1.尿液检查： 有镜下血尿，并发感染时有白细胞增高和脓细胞，有晶体。测定24h尿钙、尿酸、肌酐、草酸含量，以了解代谢状态，有无内分泌紊乱;尚应做尿液细菌培养。小儿有反复肉眼血尿时须检查尿钙量。正常的最高限度是4mg/(kg·24h)或尿钙/肌酐比值大于0.25。
2.血液检查： 可有贫血，有感染时，血白细胞增高，双侧积水致肾功能受损，出现尿毒症，血肌酐增高。应测定血钙、磷、碱性磷酸酶及药敏试验等。
影像学检查：
1.泌尿系平片(KUB)： 95%以上的肾、输尿管结石能在X线平片上显影。加拍侧位片，以排除腹内其他钙化阴影如胆囊结石、肠系膜淋巴结钙化、静脉石、粪石等，这些阴影均位于椎体前缘之前，而上尿路结石一般位于推体前缘之后。结石过小或钙化不足常给诊断带来困难。
2.排泄性尿路造影(IVU)： 可了解结石、尿路管腔形态和肾功能，有无引起结石形成的局部因素。透X线的尿酸结石在显影的肾内表现为充盈缺损。
3.膀胱镜检查和逆行输尿管肾盂造影： 必要时行膀胱镜检查。膀胱镜检查能窥视嵌顿在输尿管口的结石。逆行输尿管肾盂插管造影适用于IVU后仍诊断不明的病例，以了解梗阻的部位、程度和性质。
4.B型超声检查：肾结石的典型声像学表现是肾内见强回声光团，其后伴有声影。但也可因结石的大小、成分、形态等不同，其声像学表现也有所不同。能发现X线平片不能显示的小结石和阴性结石，了解肾的形态和肾积水的情况。对一些不适宜作IVU的病例，如孕妇、对造影剂过敏者、无尿或慢性肾衰竭者等，可作为诊断和选择治疗方法的手段。
5.输尿管镜检查： 当腹部平片没有显示结石，IVU显示充盈缺损而不能确诊时，作此检查能明确诊断，同时能进行取石或碎石。
6.CT检查 能够发现平片不显影的结石。
