(1)周围血象
细菌感染多伴有白细胞总数及中性粒细胞增多，病毒感染则往往正常或降低。白细胞计数及分类中淋巴细胞明显增多者，可以考虑百日咳。嗜酸性粒细胞增多者，须高度怀疑寄生虫感染或过敏性疾患。
(2)大便检查
怀疑有寄生虫感染，作大便常规检查找虫卵。
(3)痰液检查。
(4)病原学检查
耳鼻、咽拭子或分泌物作培养或病毒分离，有条件可作免疫荧光检查。疑有百日咳时可作培养。婴幼儿疑有结核感染时，可以做PPD试验。
( 5)血清学检查
必要时可做冷凝集试验，补体结合试验或中合试验等。
(6)结核菌素试验。
(7)X线检查
咳嗽持续存在，而未能以病史或体检之发现来解释，复发或有必要进一步的明确病变性质者，可行胸部X线检查、副鼻窦X线检查，必要时作支气管造影。
(8)支气管镜检查
疑有异物吸入或反复咯血原因不明者，可行支气管镜检查。咳嗽原因不明者，必要时可行肺穿刺或肺活检。
