易并发支气管肺炎，少数病例可发生DIC，偶见脾破裂及大出血，此外有中耳炎、心内膜炎、多发性关节炎等流产、眼炎、哮喘加剧和多形红斑.。
蜱传型复发病例后期常有眼并发症如虹膜炎，虹膜睫状体炎和脉络膜炎以及中枢神经系统并发症如脑膜炎及颅神经损害等，并可留有视力障碍和神经麻痹等后遗症。
虱传回归热易并发肺炎，中耳炎，心内膜炎，偶有脾破裂大出血，蜱传回归热于多次复发后，可引起虹膜睫状体炎，脑膜炎，脑炎等，可有视力障碍和神经麻痹等后遗症。
