胆道蛔虫症的并发症主要有下列几种：
1.胆道感染：多为大肠埃希菌感染，患儿发热，右上腹压痛紧张范围扩大，且持续存在，有时于右季肋下能摸到肿大疼痛胆囊，末梢血象白细胞增高。
2.胆道坏死：原来的阵发性剧痛减轻，但剑突及右季肋下压痛区扩大，并出现腹肌紧张，如有坏死穿孔，则肌紧张范围更扩大至左上腹或右下腹，发生胆汁性腹膜炎时，出现全腹膨胀，肌紧张，并有时出现休克。
3.肝炎和肝脓肿：蛔虫引起的肝炎表现为肝大并有压痛，高热，白细胞增高以及转氨酶上升，脓肿形成时，原有的阵发性剧痛消失，而以高热，肝大及压痛为主要症状，肝脏超声波检查可测知单一或多发脓肿，有时肝脓肿破入膈下或胸腔，出现膈下脓肿或脓胸。
4.胰腺炎：由于胆道出口括约肌痉挛及蛔虫堵塞胆道出口，使胰液反流而发生急性胰腺炎，左上腹有压痛和腹肌紧张，血及尿淀粉酶增高。
5.肝脏，胆道出血：蛔虫上行入肝内小胆管，因严重感染可导致肝或胆道出血，经消化道排出，表现为大量血便，呕吐咖啡样物或呕血。
6.胆石症：胆道内蛔虫卵或蛔虫残体都可成为核心，形成结石，是胆道蛔虫的后遗症，在儿童期很少见。
