可出现脑动脉栓塞，周围动脉栓塞，肺栓塞，心功能不全，心脏性猝死等并发症。
1.脑动脉栓塞：是房颤的最常见并发症之一，流行病学统计，心房纤颤患者脑卒中的发生率为2%～6%，房颤患者并发全身栓塞中75%为脑动脉栓塞，脑栓塞的栓子主要来自左心房和心耳部，75%的栓子来自左心房内附壁血栓，25%来自动脉粥样硬化斑块的脱落。
2.周围动脉栓塞：周围动脉栓塞的患者80%有心房颤动，房颤患者的心脏附壁血栓脱落后，随动脉血流向体循环远端造成急性动脉栓塞。
3.肺栓塞：房颤患者右心的血栓脱落造成肺动脉及其分支的栓塞发生肺栓塞，肺栓塞的病死率高达20%～40%，美国统计每年有5万～10万的肺栓塞患者，占美国死亡原因的第3位。
4.心功能不全：心房颤动的心室率与患者心功能的状态密切相关，当房颤并快速心室率时，尤其心脏功能基础较差时，引起心排血量显著地急剧降低，导致组织器官灌注不足和急性淤血综合征，可并发急性心力衰竭，临床上以急性左心衰较为常见。
5.心脏性猝死：快速房颤时，心室率加快，有效心输出量减少，冠状动脉灌注量减少，可导致心脏骤停，房颤导致心脏猝死的主要原因有：房颤伴有预激综合征；肺动脉栓塞；急性心功能不全；神经，精神因素等。
