1、肠出血：发生率少于1%，一般可发生于阿米巴痢疾或肉芽肿患者，因溃疡侵及肠壁血管所致，大量出血每因溃疡达于粘膜下层，侵袭大血管，或肉芽肿破坏所致，大量出血虽少见，但一旦发生，病情危急，常因出血而致休克，小量出血多由于浅表溃疡渗血所致。
2、肠外并发症：阿米巴滋养体可自肠道经血流一淋巴蔓延远处器官而引起各种肠外并发症，其中以肝脓肿为是常见，其次如肺，胸膜，心包，脑，腹膜，胃，胆囊，皮肤，泌尿系统，女性生殖系统等均可侵及。
