在流行期间，其主要措施为：
①个人卫生：不用脏手揉眼，实行分巾分盆，避免接触眼睛。
②公共卫生：要对游泳池，浴室，理发店以及集体单位的浴池和洗脸池严加卫生管理。
③隔离传染源：对患者应采取隔离措施，防止传播，在本病流行期间，对于车站，码头，应加强检疫工作，严禁病人外流。
④在没有肯定有效的抗病毒药前，不要乱用“预防性眼药水”，以兔交叉感染；
⑤加强消毒工作：肠道病毒对热及干燥敏感，加热至60℃分钟即可灭活，常用的消毒剂如酒精（50%30秒，70%10少，90%10秒），碘剂（0.2%PA碘1分钟），石炭酸（1%5分钟）及甲酚（3%15分钟）都有较好的灭活作用，建议临床上采用70%酒精（90%的刺激性太强）洗手等待干燥，以作为消毒措施，临床实验证明采用干扰素点眼，可预防本病的发生，由于经济价值较高，在大流行期间尚无实际应用价值。
对于神经系统并发症的预防，目前尚无有效方法，AHC患病期间，避免疲劳和禁止肌肉注射，对于减轻症状或减少该合并症的发生可能直到一定的作用。
