非结核性分枝杆菌感染人体后，不会引起急性发病，无急性临床症状，化脓过程常常于不知不觉中发展，有时延误诊断可达3～5年。
1.鸟型细胞内的分枝杆菌(mycobacterium avium intracellulare，MAI)播散后仅侵犯骨和关节，经治疗后极易复发，堪萨斯分枝杆菌，除临床上表现为肺部病变外，也可有广泛骨关节和关节周围病变，常见有腕管综合征，关节炎，骨髓炎，筋膜炎，腱鞘炎，海鱼分枝杆菌生活于鱼和水中，感染部位多见于手和膝关节，表现为关节滑膜炎，也可累及肌腱，韧带和骨骼，偶发分枝杆菌与兔分枝杆菌的复合体，可引起滑膜炎，软组织感染和骨骼感染。
2.堪萨斯分枝杆菌的临床表现为慢性肺部病变，也可有广泛的骨，关节和关节周围的病变，常见腕管综合征，关节炎，骨髓炎，筋膜炎和腱鞘炎，也在关节置换术后复发。
3.海鱼分枝杆菌生活在水和鱼中，感染与职业及个人癖好有关，感染部位多见于皮肤，肌肉和骨骼系统，尤以手和膝关节更多见，临床表现为滑膜炎，肌腱，韧带以及骨骼也可累及。
4.偶发分枝杆菌与兔分枝杆菌的复合体能引起骨髓炎，滑膜炎和软组织感染，必须强调的是临床上不活动和疾病的静止并不意味感染已治愈，需要继续随访和监督。
根据临床表现及特点，结合特征性体征即可诊断。
