GPC的初期症状比较轻微，表现有轻度的刺激症状，稀薄的黏性分泌物和轻度的瘙痒感，如果不进行适宜的治疗，病情将逐渐加重，因黏性分泌物和蛋白覆盖镜片表面，可出现视力模糊，戴镜期间持续性的异物感迫使患者减少戴镜时间，当病情达到某一程度时，将迫使患者停止戴镜而就诊，去除镜片后的瘙痒感和睡醒后眼睑粘在一起也是GPC的常见主诉。
GPC进展比较缓慢，早期主要表现为上睑结膜轻度充血和增厚，随着疾病的进展，炎细胞浸润增加，结膜开始明显增厚和混浊，疾病早期的分泌物为细丝状，随着疾病的进一步加重，出现白色黏液性分泌物，通常位于下穹隆，连续配戴接触镜或与刺激物相接触，将导致结膜的进一步充血和炎症反应，睑结膜将出现乳头并逐渐增大，在正常生理状态下，乳头的直径小于0.3mm，巨乳头性结膜炎的乳头直径大于0.3mm，当乳头直径大于1.0mm时，即称为巨乳头。
有关乳头的外观和位置存在着较大的变异性，A1lansmith将上睑结膜分为3个区：1区为睑板上缘附近的结膜;3区为靠近睑缘的区域;介于两者之间的为2区，软接触镜相关性巨乳头结膜炎的乳头首先出现在1区，然后进展到2区和3区，而硬性区，然后进展到2区和1区，因暴露缝线，带状角膜变性和青光眼滤过泡而发生的GPC，其特征为在刺激区出现较大的簇状巨大乳头，这些体征提示慢性机械性刺激是这些病例发生巨乳头性结膜炎的重要诱发因素。
Allansmith根据GPC的临床表现将其分为4期：
Ⅰ期：在早晨有少量黏液性分泌物，取出镜片时有痒感;镜片表面偶有沉积物;睑结膜外观正常，可伴有轻，中度充血。
Ⅱ期：黏液性分泌物和瘙痒感加重，对接触镜的感觉增加;镜片表面有沉积物;视力轻度下降;常在戴镜后几个小时即出现症状，患者戴镜能力下降或受到限制，裂隙灯检查见上睑结膜轻度充血，增厚，睑结膜可见大小不一的乳头，直径多在0.3mm以上，相邻的几个乳头可以融合，由于组织增厚而隆起，荧光染色后更清楚。
Ⅲ期：黏液性分泌物和瘙痒感明显加重，镜片表面经常有沉积物，很难保持镜片清洁;每次瞬目均有接触镜存在的感觉，镜片移位过度，导致波动性视物模糊;戴镜时间明显减少;上睑结膜明显充血和增厚，血管模糊不清，乳头大小和数目增加，乳头隆起，由于结膜下形成瘢痕，乳头顶部呈白色，荧光素着色。
Ⅳ期：患者完全不能忍受戴镜，戴镜后很短时间就感觉不适;镜片表面很快形成沉积物和污浊，镜片移位很大，黏液性分泌物相当多，严重者在早晨眼睑黏在一起，上睑结膜乳头进一步增大，直径多大于1mm，乳头顶端扁平，荧光素着色。
GPC的临床分型表明了病变的进展过程，但不同个体也常有一定的差异，一些患者虽然只有早期的上睑结膜改变，但有严重的自觉症状;而另外一些患者无自觉症状，但上睑结膜却有明显的炎症和乳头增生。
季节性变态反应和常年过敏性结膜炎是软性接触镜患者的一个危险因素，GPC患者对接触镜保存液，药物，真菌，花粉和动物过敏的发生率高于无GPC接触镜配戴者。
