大部分阴道Crohn病者伴有回结肠炎或有肠切除史，Crohn病外阴病灶临床可以表现为外阴肿胀，外阴压痛，会阴部溃疡，皮肤皲裂，皮赘，其他少见的症状还有双侧或单侧外阴肥大，多行性红斑，外阴脓肿，会阴瘘管或窦道形成等，Crohn病外阴病变表现多样，容易被误诊，尤其是没有肠道症状作为Crohn病的首发症状的时候，约有半数以上患者还会出现月经异常。
常见症状为发热，腹痛，腹泻和易疲劳，部分病人出现腹胀，下腹部肿块，14%～17%的病人出现肛周瘘管和窦道，其中21%的瘘管和腹腔相通，肠外损害包括关节，皮肤，肝胆等，可以表现为关节炎，脂肪肝，小胆管周围炎，硬化性胆管炎，肝周脓肿，其他少见的症状还有结节性红斑，坏疽性脓皮病，吸收障碍综合征，舌炎，咽部溃疡等。
