典型临床病程可分为4期：甲状腺毒症期(早期)，甲状腺功能正常期，甲状腺功能减退期(甲减)和恢复期，但有一半的病人并无甲减期而仅有前二期。
1.甲状腺毒症期：
主要的临床表现是甲状腺滤泡破坏后，甲状腺激素溢出而形成的甲亢症状。发病突然，一般全身症状与其他疾病所致甲亢表现并无差别，其临床特点有：
(1)发病前一般无病毒感染的前驱症状，无碘接触史。
(2)通常表现为轻度或中度甲亢，约10%病人可出现高代谢状态，一般无突眼，约80%病人可无任何临床症状。
(3)无发热，约50%的病人血沉增快。
(5)甲状腺无痛亦无触痛，是ST的显著特点。
(6)无胫前的黏液性水肿。
(7)血清T3、T4、FT3、FT4均可升高，TSH降低。
(8)甲状腺131I吸收率明显下降和延迟，尤其24h吸收率在3%以下，给予甲状腺素后并不回升。
(9)约50%的病人弥漫性或局灶性淋巴细胞浸润，组织纤维化和Hurthle细胞极少见，未见亚急性甲炎的肉芽肿改变。
(10)尿碘含量升高。
2.甲状腺功能正常期：
ST病人一般在2～6个月内症状缓解，血清T3、T4下降，131I吸收率升高达正常水平，甲亢症状消退，此期可持续数周。
3.甲状腺功能减退期：
约1/4～1/3病人血清T3、T4可进行性下降而出现甲减，TSH升高，此期可持续1～6个月，通常不超过1年；临床可出现甲减表现，轻者可在短时间内自行缓解，极少发展为永久性甲减。
4.恢复期：
临床症状消失，血清甲状腺激素水平和131I吸收率均恢复正常，部分病人不经过甲减期就直接进入恢复期。
产后型病人的临床表现常短暂而模糊，有明显的个体差异性。病人多在产后1～6个月出现甲亢表现，起病较急；特征为产后一过性，无痛性，弥漫性或结节性甲状腺肿大；甲亢表现较轻，主要为体重减轻，明显疲乏感，心悸，食欲增加及神经系统症状，如怕热、多汗、紧张、焦虑、注意力不集中、记忆力下降，血清T3、T4、FT3、FT4升高，TSH下降，131I吸收率下降，80%以上病人TPOAb阳性，而TGAb阳性者约1/3；仅有40%的病人具有特征性甲状腺功能演变过程，60%的病例只有甲亢期，经治疗后直接过渡到恢复期。无甲状腺功能改变的患者，往往仅有无痛性甲状腺肿大。产后型ST病人再次妊娠时复发率可高达50%。
