多为缓慢发病，无特殊感觉，常因甲状腺肿大而就诊；病初期甲状腺常不同程度的呈弥漫性肿大，多右叶大于左叶，表面光滑，质地柔软，无结节；随病程延长甲状腺肿大明显，伴有结节，质地中等硬度或坚硬，无压痛，甲状腺功能正常，8%可引致甲亢，约60%病人出现甲低的症状，因滤泡上皮高度变性和纤维化而导致永久性甲低。
慢性淋巴性甲状腺炎，常常发生在其他自身免疫性疾病中，作为该病的一部分，称为自身免疫多腺体综合征。Carpente报道自身免疫性甲状腺疾病(CLT.Grave自发性黏液性水肿)合并Addison病和胰岛素依赖性糖尿病(IDDM)，并指出这些受侵腺体，均有淋巴细胞浸润，常见于女性，女∶男之比约为2∶1。而Danmak研究提出这些病人与HLA-Bg(A1)型有关。在儿科中最常见的多腺体综合征为IDDM合并有自身免疫性甲状腺疾病，最常见为合并CLT甲状腺肿，甲状腺功能正常，甲状腺抗体阳性，对这类病人定期测定甲状腺功能和血中抗体水平极为重要。
也有报道自身免疫性甲状腺疾病伴恶性贫血和Cetrophie消化道炎症。Florida近来报道了88例成人甲状腺肿和甲状腺炎病人，发现血清中消化道壁细胞抗体为14%，均有恶性贫血，也有些患者自身免疫性甲状腺疾病患者伴有部分或全部脱发者。
