诊断标准
1.病史及流行情况 要详细询问病史，了解流行病学情况，有助于诊断。
2.临床表现 要详细观察大便性状，同时要密切观察病情发展，新生儿脱水程度较难估计，尤其对早产儿，皮下脂肪少，用皮肤弹性估计脱水并不准确，最好根据连续的体重记录，尿量测量。
3.病原学检查 要及时留取标本做细菌培养，如怀疑轮状病毒感染，要同时查病毒抗原，如怀疑真菌感染，大便镜检可见真菌孢子和菌丝。
4.血气分析和电解质检查 新生儿腹泻易发生酸中毒和电解质紊乱，应及时做血气分析和电解质检查，做到及时治疗。
鉴别诊断
感染与非感染性腹泻根据临床有无感染症状容易鉴别，肠内感染性腹泻和肠外感染性腹泻，前者腹泻症状重，后者只是症状性腹泻，有原发感染性疾病的表现，也易鉴别，新生儿流行性腹泻病根据流行病史和实验室检查可确诊。
1.肠内感染性腹泻
(1)流行病学史：根据病史特点进行鉴别分析，婴儿室有腹泻流行，提示有大肠杆埃希菌，鼠伤寒沙门菌，变形杆菌或病毒性肠炎之可能，母亲有发热，早期破水，产程长或窒息史等，要考虑有感染性腹泻的可能。
(2)临床表现：根据症状体征特点进行鉴别分析，腹泻早期即出现体温异常，发热或体温过低，面色不佳，呕吐，大便含黏液或脓血，镜检有红，白(脓)血球，提示为感染性腹泻，进一步便涂片染色检查，培养或病毒分离，可鉴别肠炎性质(病原)。
2.肠外感染 有感染中毒症状，有原发感染性疾病表现，便镜检有少量白细胞。
3.非感染性腹泻 如糖类消化吸收不良，脂肪消化吸收等，无感染表现。
