临床诊断应从本病患儿的临床特点和流行病学资料两方面分析提出。
1.婴儿的临床特点：围产新生儿发病急剧，有不明原因的发热;有上呼吸道感染或败血症样表现，合并心肌损害;有感染的临床表现，但病情进展迅速，病情危重，不支持细菌感染者。
2.流行病学资料：新生儿集中发病，夏秋季节;母亲或婴儿室医护人员近期有发热等感染病史，同婴儿室有类似上呼吸道感染，发烧患儿同期发病或相继起病者。
上述临床特点结合实验室检查和辅助检查可确诊。
和败血症相鉴别，和TORCH综合征相鉴别。
