对暴发流行时的诊断，一般并无困难，在多发特定职业人群中，根据临床表现及流行病学接触史等，也不难诊断，根据病原学血清学的阳性结果，即可作出确诊，但在散发病例中误诊率高达80%～100%。
急性期应与伤寒，钩端螺旋体病，布氏杆菌病，Q热及病毒性感染等发热疾病相鉴别，一旦肺部出现病变及呼吸道症状时，应与细菌性肺炎鉴别，若病情较轻而又咳嗽不止时应与衣原体肺炎鉴别，剧烈头痛应与脑膜炎鉴别。
