诊断：
根据本病的特点，凡在生育年龄的妇女有进行性加剧的痛经或伴不孕史，妇科检查可扪得盆腔内有不活动包块或痛性结节者，一般即可初步诊断为盆腔子宫内膜异位：症，对于病情稍复杂者，还可进一步借助上述实验室检查及特殊检查方法进行诊断，一般诊断并不困难，但在诊断的过程一定要详细询问病史，认真进行妇科检查，：尤其是妇科的三合诊检查，综合分析病情以得出正确的诊断。
鉴别诊断：
1.卵巢恶性肿瘤：患者一般情况差，病情发展快，常常伴有持续性腹痛，腹胀，妇科检查时可扪及盆腔包块，若肿瘤压迫盆底神经或肿瘤组织坏死出血，可出现下腹及腰骶部胀痛，同时伴有腹水，B超检查显示肿瘤为实性或混合性，形态不规则。
2.盆腔炎性包块：附件炎性包块多由炎症或者结核病引起，仔细询问病史，患者多有急性盆腔感染和反复发作史或者结核病史，患者不仅经期疼痛，而且平时也伴有腹部隐痛，同时伴有发热，经抗炎或抗结核治疗有效，妇科检查时可于一侧或双侧附件区扪及不活动，界线欠清之包块，一般黏于子宫后方，如与盆腔子宫内膜异位症鉴别诊断有困难时可行B超检查或子宫输卵管碘油造影检查，进一步明确诊断。
3.子宫腺肌病：患者也可有痛经，但子宫一般均匀性增大，质硬，经期检查子宫压痛明显，且有经期子宫增大，经期后子宫缩小的特征，B超检查可见子宫肌层内不规则回声增强，因子宫腺肌病常常与盆腔子宫内膜异位症并存，因此附件区有时也可扪及包块。
4.直肠癌：直肠癌患者大便经常带血或便血，且症状不受经期影响，肛诊时手指套有血染，但当盆腔子宫内膜异位症病情严重时，可侵犯直肠壁导致直肠狭窄，伴大便坠胀，甚至大便带血，需与直肠癌相鉴别，可行钡剂灌肠或直肠镜检查确定诊断。
5.与妇，外科急腹症相鉴别：由于卵巢子宫内膜异位症发生率的不断升高，使子宫内膜异位囊肿破裂的发生率也不断升高，当囊肿破裂时，由于大量囊内容物溢入腹腔产生突发性不可耐受的剧烈腹痛，此时往往易误诊为宫外孕，卵巢囊肿蒂扭转，阑尾炎，腹膜炎等妇外科疾病，因此在疾病的诊断过程中，应仔细询问病史，了解以往有否子宫内膜异位症病史，停经史，发热史等，均有助于进行鉴别诊断。
