关于本病的并发症，主要分为原发性纤维肌痛综合征和继发性纤维肌痛综合征两种情况：
（1）原发性纤维肌痛综合征患者，疼痛可波及全身且伴有常见的非恢复性睡眠，焦虑，抑郁，疲倦和应激性肠道综合征等。
（2）继发性纤维肌痛综合征的患者，其并发症需根据其原发性疾病来判断，外伤，各种风湿病，如骨性关节炎，类风湿关节炎及各种非风湿病(如甲状腺功能低下，恶性肿瘤)等都可能引起本病，其并发症是多种多样的，临床上需根据诊断结果积极地进行治疗与预防。
