随梗阻程度不同而并发肺不张，肺气肿，纵隔气肿和气胸，缺氧酸中毒严重者可致颅内出血和肺出血，病程迁延者常有间质性肺炎及肺部纤维化。
1.气漏和气胸
由于胎粪阻塞小气道导致气陷，使肺泡破裂，变成肺大疱，如果胸膜脏层破裂，可以出现气胸，如果气体沿肺泡间质小血管鞘漏出，可以造成纵隔气肿和心包积气，治疗上可以采用胸腔闭式引流治疗气胸，同时使用肌松剂等抑制患儿过强烈的自主呼吸活动。
2.持续肺动脉高压
一般采用吸入一氧化氮治疗，可参见持续肺动脉高压。
3.颅内出血和肺出血
缺氧酸中毒严重者可致颅内出血和肺出血。
4.肺部并发症
病程迁延者常有间质性肺炎及肺部纤维化。
