氟骨症的主要临床表现是腰腿关节疼痛，关节僵直，骨骼变形以及神经根，脊髓受压迫的症状和体征。
患者常诉说脊柱和四肢关节持续性疼痛，静止时加重，活动后可缓解，关节无红肿热等炎症表现，神经根受压者疼痛加剧，如刀割或闪电样剧痛，拒触碰或扶持，病情严重时，关节，脊柱固定，脊柱侧弯，佝偻驼背或四肢僵直，以至生活难以自理，脊髓或神经根受压者四肢或双下肢感觉麻木，躯干有被束缚感，疼痛，可伴肢体截瘫，以致蜷曲在床，咳嗽和翻身引起剧烈疼痛，患者多死于慢性营养障碍或其他严重合并症。
患者常有全身肌肉疼痛，头晕，心悸，无力，困倦及食欲减退，恶心，呕吐，腹胀，腹泻或便秘等症状，并有肌肉萎缩，肌电图改变，累及甲状腺，肾上腺，性腺及晶状体和中枢神经系统时，可引起相应症状和体征，我院曾观察了37例病人血清游离氟，甲状腺激素，TSH浓度，发现氟中毒病人血清T4及T3显著低于正常对照组，TSH显著高于正常对照组.T3浓度及T3/T4比值，与血清游离氟浓度呈显著负相关，故认为氟中毒可以降低甲状腺功能，并与血氟含量有关。
一般女性氟骨症患者的症状较男性为重，饮水氟含量在10mg/L以上的地区，脊柱僵直的女性患者可达50%，男性仅7%，脊柱侧弯，驼背或瘫痪的女性为22.2%，男性为7%，这种性别差别，可能与妊娠，生育，哺乳等有关，而且女性接触燃煤污染的空气较多，氟骨症的病程可长达数十年。
