潜伏期3～32天，大部分患者在潜伏期末或ECM发生前后出现“流感”样症状，脑膜刺激征及肌肉关节酸痛，局限性或全身淋巴结肿大，通常将早期表现ECM及相关症状称为第一期;数周至数月后出现神经，心脏异常，骨骼肌肉症状或周期性关节损害，称为第二期;数月至数年后表现为慢性皮肤，神经系统，关节受累，称为第三期，然而临床表现有明显的个体差异，轻者为亚临床感染或仅有一个系统受损害的表现，有的可同时出现皮肤，神经系统，关节，心脏等多脏器的损害，任何一个系统受累均可呈暂时性，再发和慢性化的特点，不同地域其临床特征亦可不同，在美国以关节炎更多见一些，而在欧洲则以神经系统改变为多见。
1.早期表现
游走性红斑(EM)是莱姆病的临床标志性证候，约见于90%以上病例，最初为一红斑或丘疹，出现在当初蜱媒叮食处(常已过去很久)，发红区逐渐扩大到15cm左右(范围3～68cm)时，中心常见部分消退，外缘发红，一般平伏，不带鳞屑，有时中心发红，硬结，甚至出现水疱或坏死，情况亦可差异，如可能为多环性损害，大腿，腹股沟和腋窝都是好发部位，损害触之发热，但常无痛楚，甚易疏漏，常规组织学检查为非特异性改变：真皮中单核细胞浸润厚重，表皮除蜱叮咬处外别无异常。
皮肤损害 ECM最常见，发生率约90%，好发于大腿，腋窝，腹股沟等部位，开始为一个红色斑疹或丘疹，经3～32天后(平均7～9天)，皮疹逐渐扩大形成一片大的圆形皮损，外缘边界鲜明(一般扁平，偶可隆起)，中央呈退行性变，故似一红环或皮损内又形成几圈新的环状红圈而呈靶形，皮损早期中央呈致密性红斑，硬变，疱疹，坏死，常有灼热感，偶有疼痛，瘙痒，皮损逐日扩大，直径可达6～68cm(平均16cm)一般经2～3周皮损自行消退，偶留有疤痕和色素沉着。
皮肤受累常伴有流感样症状：违和，疲惫，头痛，发热发冷，肌痛，关节痛等。
在莱姆病流行区，如在夏季出现以上证候，即使没有EM，也应给予治疗，有些病人有脑膜刺激或轻度脑病征象，如发作性剧烈头痛和颈痛，强硬或压迫感，但此期一般都只持续数小时，CSF无细胞数增多，亦无神经缺失的客观病征，除疲惫和嗜睡常为经常性外，其他早期证候一般都是间歇性和可变的，如患者可能出现脑膜炎样发作数日，好转数日，又发生游走性筋骨痛，波及关节(一般不致肿胀)，肌腱，滑囊，肌肉和骨，疼痛一次常只累及一二处，每个疼痛处持续数小时至数日不等，EM发生前数日，可有不同相关症状(亦可无EM)，皮肤损害消失后，仍能持续数月(特别是疲惫和嗜睡)。
2.较后期表现
(1)神经系统表现：起病数周至数月，主要指神经系统实质性损害，不包括病理初期“脑膜炎”样表现，发生率为11%～15%，其中以脑脊髓膜炎，脑炎，颅神经炎，运动和感觉神经炎最多见，亦可发生舞蹈病，小脑共济失调，脊髓炎，多数表现为神经系统广泛受累，病变可重叠出现，少数表现为局限性神经系统受累，如面神经瘫痪，Bell样麻痹亦可单独发生，通常神经系统表现出现在ECM后的2～4周，亦可由早期脑膜炎症状发展为慢性脑膜炎，有脑膜炎症状的病人，此时CSF可有淋巴细胞增多(约100/mm3)，脑电图上有时可见弥漫性慢波，但颈项强硬罕见(除非极度屈颈);Kernig氏征及Brudzinski氏征皆无，无ECM者，神经系统症状常先于关节症状，神经证候通常持续数月，但一般都能完全恢复(晚期神经合并症见后)。
(2)心脏表现：也是在起病数周至数月内，约8%病例心脏受累，以成年男性居多，以房室传导阻滞最为常见，尤其是I度或Ⅱ度房室传导阻滞为最多，有些病人心脏受累更广泛，如出现急性心肌心包炎的心电图改变，核素扫描显示轻度左室功能失常等，心脏扩大亦偶见，少数病人可有房颤，心脏损害一般较轻，心瓣膜无明受损，持续时间短，心脏受累常为时短暂(7天至6周)，但可复发。
(3)关节表现：起病后短则数周，长至2年，约60%病例发生明显关节炎，通常在6个月内出现，早者可与ECM同时出现，迟者可在其后14个月发生，通常从1个或少数几个关节(单侧，非对称性)开始，初呈游走性，可累及多个关节，以膝关节最多见，其次为肩，肘，踝，髋及颞下颌关节，偶见指(趾)关节受累，通常表现为间歇性发作的非对称性关节肿胀和疼痛，主要在大关节(特别是膝)，每次累及一两个关节，膝关节受累时，肿胀常较疼痛为甚，常发热，但很少发红;可能发生Baker囊肿，并早期破裂，不过大小关节皆可受累，少数患者为对称性多关节炎，关节炎发作一般持续数周至数月不等，常经历数年复发，以后随着时间的推移，发生渐少，其余关节多表现为运动时疼痛，初发关节症状一般持续一周，个别长达6个月，复发时关节症状持续时间较短，有时损害侵蚀软骨和骨，可使关节致残。
还有部分病人在疾病早期可有肌腱，腱鞘，肌肉或骨骼游走性疼痛，可持续数小时至数天，活动性关节受累时，患者常感疲困，但发热及其他系统症状此期尚不常见，关节液中白细胞数自500～11万/mm3不等，平均约2.5万/mm3，以多核细胞为主，蛋白总量3～8g/dl，C3和C4水平一般>血清1/3，葡萄糖水平>2/3，类风湿因子及抗核抗体皆阴性。
约10%关节炎病人的大关节受累可成慢性损害，有血管翳形成及骨与软骨侵蚀，滑膜活检所见类似类风湿性关节炎，有纤维蛋白沉积，绒毛肥大，血管增生，大量单核细胞浸润，还可见到闭塞性动脉内膜炎，偶能见到螺旋体，前已指出，伯氏疏螺旋体能促使单核细胞产生细胞因子(如白介素-1，肿瘤坏死因子-α，白介素-6)，滑液中炎症性细胞因子浓度增高，一例慢性莱姆关节炎病人，组织培养中生长的滑膜产生大量胶原酶(collagenase)和前列腺素E2 (prostaglandin E2)，可见莱姆病时关节液中细胞数，免疫反应物(除类风湿因子外)，滑膜组织改变，滑膜释出的酶量及由此所致骨与软骨破坏情况，可能都与类风湿性关节炎相似。
(4)其他：与这种感染有关的其他晚期改变，还有一种皮肤损害，即欧洲广为人知的慢性萎缩性肢端皮炎，但在美国仍鲜有之，它是略带紫色的浸润性斑块或结节，多见于伸侧，最终发生萎缩，晚期罕见慢性神经病变还有横贯性脊髓炎(transverse myelitis)，弥漫性感觉性轴突神经病和CNS髓鞘脱失性损害等，轻度记忆障碍，轻微情感性改变和慢性疲劳状态等亦常有之。
约10%患者早期出现肝炎样症状与体征，少数患者有弥漫性腹痛，腹泻，脾肿大，眶周水肿及睾丸肿痛等表现，部分患者可发生虹膜炎，甚至全眼炎而导致视力丧失。
本病尚可通过母婴传播引起先天性感染，有报告孕妇3个月内感染未经抗生素治疗，35周分娩后婴儿于l周内死于先天性心脏病，婴儿尸检时发现脾，肾，骨髓中存在伯氏包柔螺旋体，还有人报告19例孕期患莱姆病者，5例出现婴儿并指(趾)，中枢性失明，死胎，早产，早熟等。
莱姆病的诊断有赖于对流行病学资料，临床表现及实验室检查结果综合分析：
1.流行病学资料：近数日至数月曾到过疫区，或有蜱叮咬史；
2.临床表现：早期有典型皮肤损害，即ECM者，以后又有心脏，神经，关节等受累；
3.实验室检查：从感染组织或体液中分离到病原体，或检测到特异性抗体。
