慢性萎缩性胃炎的临床表现不仅缺乏特异性，而且与病变程度并不完全一致，临床上，有些慢性萎缩性胃炎患者可无明显症状，但大多数患者可有上腹部灼痛，胀痛，钝痛或胀满，痞闷，尤以食后为甚，食欲不振，恶心，嗳气，便秘或腹泻等症状，严重者可有消瘦，贫血，脆甲，舌炎或舌乳头萎缩，少数胃粘膜糜烂者可伴有上消化道出血，其中A型萎缩性胃炎并发恶性贫血在我国少见，本病无特异体征，上腹部可有轻度压痛。
