本病的临床表现多样化，感染了本病毒后，表现可以从无症状感染，流感样全身性疾患，脑膜脑炎以至于严重的脑膜脑炎，但各型之间没有截然的分界线，不同的临床表现是否与不同的病毒株有关，目前尚未能肯定。
流感样全身症状是最常见的临床表现，潜伏期一般为8～12天，起病急，发热可高达39.5℃，伴有背痛，头痛，全身肌肉酸痛，有些患者出现咽痛，咳嗽与其他上呼吸道感染的症状，少数还可有皮疹，淋巴结肿大与压痛，恶心，呕吐与腹泻等表现，病程一般在2周左右，部分患者，经过一段间歇后，可有第二次，甚至偶尔有第三次类似的发作，但症状常较轻，持续时间较短，多数患者逐渐恢复，有些则发展到脑膜炎。
脑膜炎患者起病时可先有流感样全身性症状，也可以一开始就以头痛，颈硬，呕吐，腰背肌肉痛等脑膜刺激征为主要特征，但病情不如化脓性脑膜炎严重，脑脊液检查符合淋巴细胞性脑膜炎的特征，病程一般持续1～2周，脑脊液的改变较症状恢复稍迟。
偶尔病变波及脑脊髓实质，出现脑膜脑炎的表现，病者可有个性改变，谵妄，嗜睡，甚至昏迷，亦可有脑神经与外周神经的感觉丧失与运动障碍，腱反射的改变等，个别严重者可致死。
只具有流感样全身症状的患者，由于临床上缺乏脑膜炎表现，没有指征做腰椎穿刺，诊断只能依靠流行病学资料的提示，以及病毒血清学诊断证据，此类患者脑脊液检查可出现异常。
有脑膜炎表现的患者，脑脊液检查有一定帮助，脑脊液中的细胞数增加(即使在病程早期，仍以淋巴细胞占绝大多数)，糖含量稍低，对诊断本病有一定提示，但是，脑脊液改变也是非特异性的，难以与其他原因的淋巴细胞性脑膜炎鉴别。
