(一)发病原因
引起坏死性小肠结肠炎的原因尚未完全阐明，但一般认为是由多种原因联合所致，其中以早产和感染最为重要。
1.早产：早产是NEC的重要发病因素，因免疫功能差，肠蠕动差，加之出生时易发生窒息，造成肠壁缺氧损伤，使细菌侵入。
2.感染：感染是NEC的主要原因之一，大多为克雷白杆菌，大肠埃希杆菌，铜绿假单胞菌等肠道细菌。
3.缺氧与缺血：在新生儿窒息，呼吸疾病，休克等缺氧缺血情况时肠壁血管收缩，导致肠黏膜缺血缺氧，发生坏死，随着恢复供氧，血管扩张充血，扩张时的再灌注会增加组织损伤。
4.喂养：进食和交换输血都可增加肠壁的再灌注，成为诱发疾病的原因,导致肠道受细菌的侵袭，一旦开始喂养,为肠道细菌繁殖提供了充足的底物，肠道喂养一直被认为是NEC的发病因素，感染，窒息的早产儿过早，过量喂牛乳，可诱发NEC，但喂养导致NEC的观点仍然存在争议，有报道延迟至2周开始喂养的早产儿NEC发生率反而高于早喂养者。
5.其他：脐动脉或静脉插管，换血疗法，红细胞增多症，动脉导管开放，低体温等情况时，NEC发生率较高。
(二)发病机制
在发生坏死性小肠结肠炎的患儿中,小肠中通常有3个因素出现：持续的肠缺血损害，细菌定植，肠腔内底物(如经肠喂养)。
1.肠壁缺氧和炎症损伤：早产儿免疫功能差，肠蠕动差，食物停留时间长，易使细菌生长;牛乳渗透压较高，感染，窒息的早产儿过早过量喂牛乳，可加重肠壁黏膜损伤，诱发NEC，出生时窒息造成肠壁缺氧损伤，使细菌得以侵入，过多细菌生长及其毒素可使缺氧的肠壁发生炎症，炎症时组织释放的细胞因子，如血小板活化因子，α肿瘤坏死因子，前列腺素等，加重炎症反应，促使NEC的发生，克雷白杆菌对食物中的乳糖有较强的发酵作用，产生的氢气使肠壁产生囊样积气。
2.缺氧与再灌注损伤：缺血性损害可由于缺氧性损害，如新生儿窒息，呼吸系统疾病，所触发的原始潜水反射，引起的肠系膜动脉痉挛,导致肠道的血流明显减少;在换血过程中,败血症时期或用高张力配方奶喂养时,肠道血流减少，导致肠缺血性损害，同样,休克，先天性心脏病等缺血情况时，可减少体循环血流,或动脉血氧饱和度的降低,导致肠黏膜缺血缺氧，发生坏死;恢复供氧，进食和交换输血时的再灌注，增加了组织损伤。
3.病理改变：NEC可累及整个小肠和结肠，但好发部位多在回肠远端和升结肠近端，轻症时坏死肠段只有数厘米，重症时可伸延至空肠和结肠部位，但一般不影响十二指肠，细菌可渗透过肠壁,产生氢气并积聚,产生X线上特征性的肠壁积气,气体并可进入门静脉,通过腹部X线平片或肝脏B超可见到肝脏上面的门静脉积气，随着病变的进展,可导致整层肠壁的坏死，穿孔,腹膜炎,败血症和死亡，早期病变主要为肠黏膜及黏膜下层充血，水肿，出血，坏死，进展期病变范围扩大，累及肌层，严重者肠壁全层坏死，可并发肠穿孔和腹膜炎。
