全身性疾病是一种内在性的因素。例如结核、风湿、梅毒等引起的变态反应性角膜炎。全身营养不良，特别是婴幼儿维生素A缺乏引起的角膜软化症，以及三叉神经麻痹所致的神经麻痹性角膜炎等。此外尚有原因不清楚的蚕食性角膜溃疡等自身免疫性疾病以及糖尿病等全身疾病。
外伤与感染是引起角膜炎最常见的原因。当角膜上皮层受到机械性、物理性和化学性等因素的损伤时，细菌、病毒和真菌等就趁机而入，发生感染。侵入的致病微生物既可来源于外界的致伤物上，也可来自隐藏在眼睑或结膜囊内的各种致病菌，尤其慢性泪囊炎，是造成角膜感染的危险因素。主要病原微生物有细菌、病毒、真菌、棘阿米巴原虫、衣原体、结核杆菌、梅毒螺旋体等。
引起角膜炎的原因：角膜邻近组织疾病的影响。例如急性结膜炎可引起浅层点状角膜炎，巩膜炎可导致硬化性角膜炎、葡萄膜炎也可引起角膜炎。眼睑缺损合并睑裂闭合不全时，可发生暴露性角膜炎等。
病理
分为浸润期、溃疡形成期、溃疡消退期、愈合期
第一阶段为浸润期 致病因子侵袭角膜，引起角膜缘血管网充血，炎性渗出及炎症细胞随即侵入病变区，产生的酶和毒素扩散，造成角膜组织破坏，形成局限性灰白色混浊灶。
第二阶段为溃疡形成期 因致病菌的侵袭力和产生的毒素不同致炎症严重程度不一。坏死的角膜上皮和基质脱落形成角膜溃疡。
第三阶段为溃疡消散期 给予药物治疗及自身体液、细胞免疫反应，抑制了致病因子对角膜的侵袭，以及组织里基质胶原的进一步损害。
第四阶段为愈合期 溃疡区上皮再生，前弹力层和基质缺损由成纤维细胞产生的瘢痕组织修复。溃疡愈合后，根据溃疡深浅程度的不同，而遗留厚薄不等的瘢痕。
临床常见角膜炎的形成
匐行性角膜炎：主要为毒力较强的细菌引起。肺炎球菌、溶血性或绿色链球菌、淋球菌、枯草杆菌、金黄色葡萄球菌等均可致病。发病前常有角膜表面外伤史，或有灰尘等异物入眼。全身营养不良、衰弱亦易于发病;慢性泪囊炎患者易患此病。
绿脓杆菌性角膜炎：本病系绿脓杆菌直接侵入角膜引起感染所致。绿脓杆菌毒力很强，但侵袭力很弱，它必须通过破损的上皮才能侵犯角膜组织引起感染。因此，各种角膜外伤、角膜炎、角膜软化症等均可成为感染的诱因。
