本病在流行期间不难诊断，该期内凡发现有球结膜充血及上眼睑肿胀的患者，都应首先考虑本病，典型特征为急性泡性结膜炎和炎症晚期出现的角膜上皮下浸润，其最终诊断还取决于病毒分离和血清学检查的结果。
在流行初期或散发病例，容易和其他急性结膜炎相混淆。应与流行性出血热结膜炎、慢性疱性结膜炎、急性细菌性结膜炎。
