应注意与以下疾患相鉴别：
1.卵巢癌 卵巢癌多呈球形或分叶状，无阴道流液现象，而输卵管则常呈腊肠形或椭圆形，甚少巨大者，除腹腔镜检查以外，一般检查在术前极难与卵巢癌区别，输卵管癌的临床表现与卵巢癌很相似，所不同的是卵巢癌患者在确诊时多为晚期，而输卵管癌者明确诊断时2/3为早期，这可能是由于输卵管癌起始于输卵管腔内，而患病的输卵管又往往是闭锁的，这样就防止了癌组织迅速扩散到腹腔，另外由于输卵管的痉挛与收缩，较早出现腹痛症状，引起患者警惕并及时检查，故往往病期较早。
2.子宫内膜癌 可有阴道流液，但多见为阴道流血，通过诊刮或子宫内膜活检，阳性者往往为子宫内膜癌。
3.附件炎性肿块 输卵管积水，输卵管卵巢积水及输卵管脓肿等，在外形上难与输卵管癌鉴别，但炎性肿块常伴有周围粘连，管腔内为黄色液体或脓液，无乳头状或髓样组织，剖开标本即可与输卵管癌区别。
4.输卵管妊娠 输卵管妊娠者常有停经史，有腹痛及内出血等急腹症的表现，血HCG升高，剖开输卵管见内有胚囊或胎盘组织，开腹后不难鉴别。
