临床诊断可根据流行病学资料，临床表现和实验室检查结果进行综合分析，而确诊必须有血清学或病毒学的证据。
发热期应与上呼吸道感染，败血症，急性胃肠炎和菌痢等鉴别，休克期应与其他感染性休克鉴别，少尿期则与急性肾炎及其他原因引起的急性肾衰竭相鉴别，出血明显者需与消化性溃疡出血，血小板减少性紫癜和其他原因所致 DIC鉴别，以ARDS为主要表现者应注意与其他病因引起者区别，腹痛为主要体征者应与外科急腹症鉴别。
