诊断
摩根菌肺炎的诊断要根据临床表现，胸片和病原体检查结果综合判断，临床上对有发热，畏寒，咳嗽，咳黄痰或白痰，气促，胸痛，查体双肺有湿性啰音，胸片示双肺叶，段性浸润阴影，或有肺脓肿形成，外周血象示白细胞和中性粒细胞增高，痰液涂片革兰染色有大量阴性杆菌，应考虑该病可能，对于医院获得性肺炎，因原发病存在，肺炎症状不典型，但如出现下列表现：在原发病基础上突然高热;咳嗽咳痰加剧;不明原因的呼吸衰竭和心衰;胸片示双肺浸润阴影或在原病灶基础上出现新的浸润病灶;结合痰中有大量革兰阴性杆菌，也应考虑有本病可能，应反复查痰，血或直接下呼吸道分泌物培养，凡连续2次或2次以上痰培养均为摩根菌;或痰和血，或胸腔积液均培养出摩根菌;或直接呼吸道分泌物培养出摩根菌;或生前痰培养和死后从肺部均分离出摩根菌，结合上述表现及胸片结果即可确诊，但对于原发性或继发性摩根肺炎，临床上有时难以区别，一般认为凡在原发肺病等基础上出现摩根菌感染，为继发性肺炎。
鉴别诊断
摩根菌肺炎临床表现及胸片无特异性，与其他革兰阴性杆菌肺炎相似，临床上难以与克雷伯菌肺炎，铜绿假单胞菌肺炎，变形杆菌肺炎，沙雷菌肺炎及枸橼酸杆菌肺炎区别，主要靠痰，血或下呼吸道分泌物病原体检查，因此，对怀疑有肺部细菌感染者应多次查病原体。
