本病的临床表现缺乏特征性，故诊断较为困难，不少病例在尸检时才获确诊。为提高早期诊断率，对接受广谱抗生素治疗或大手术的患者，如出现腹痛、腹泻、发热或病情恶化而无明显原因可解释时，应警惕本病的可能性，并及时进行直肠、乙状结肠镜检查与肠粘膜活组织检查。首光检查未获确诊而病情仍无好转者，重复内镜检查常可帮助确诊。组织学检验:本病常累及下段结肠，故直肠、乙状结肠镜检查是重要的诊断手段之一，镜下所见肠粘膜的主要证象是水肿、充血、糜烂、溃疡，或呈颗粒状，可有隆起的斑片或融合成片的灰绿或灰褐色的伪膜覆盖。病变粘膜活组织检查常显示急性或慢性炎症，如发现初期绒毛顶部病变或紧贴粘膜面的伪膜则有助于诊断和区别其他的结肠炎症。
