1.肝功能异常，凝血功能异常往往只反映肝细胞的功能状态，如酶疸分离，高胆红素，低血蛋白血症，胆碱酯酶活性降低以及血清胆固醇降低等，均不能说明肝性脑病的严重程度，血生化检查如发生水，电解质及酸碱平衡紊乱可促进并加重肝性脑病，肾功能(肌酐，尿素氮)检查如异常仅预示即将或已发生肾功能衰竭，近年有人认为动态观察血清褪黑素水平对于预测，诊断肝性脑病的发生和判断病情变化有重要参考价值。
2.血氨测定 约75%HE病人血氨浓度呈不同程度增加，在慢性型病人增高者较多，急性型病人增高者较少，但血氨升高，并不一定出现肝性脑病，所以血氨浓度升高，对诊断具有一定的参考意义，对指导治疗也有参考意义，如测定动脉血氨浓度升高比静脉血氨更有意义。
3.血浆氨基酸测定 若支链氨基酸浓度降低，芳香族氨基酸(特别是色氨酸)浓度增高，两者比例倒置<1，在慢性型更明显，能同时测定GABA也常增高。
4.脑电图检查 脑电图变化对本病诊断与预后均有一定意义，正常脑电图波幅较低，频率较快，波型为α波，随着病情的变化和发展，频率减慢，波幅逐渐增高，波型由α波变为每秒4～7次的θ波则提示为昏迷前期，如变为对称的，高波幅，每秒1.5～3次的δ波则为昏迷期表现，对可疑的脑电图改变，可在进食高蛋白及肌注小剂量吗啡后脑电图改变加剧而加以明确，肝性脑病时的脑电图改变也可见于尿毒症，肺功能衰竭及低血糖等，应加以区别。
5.视觉诱发电位(visual-evoked potential，VEP) 用闪光刺激后可使枕叶视觉区皮质激起反应，产生同步放电效应，引起电位变化，即VEPs，它表示皮质及皮质下神经细胞群突触后兴奋和抑制电位的总和，对于评估肝性脑病时大脑功能障碍具有特异性，并可做定量分析，较一般脑电图更能精确反映大脑电位活动，可用以检出症状出现前的肝性脑病(如亚临床肝性脑病)，另外还有人应用听觉事件相关电位P300及体感诱发电位测定诊断亚临床肝性脑病，认为听觉事件相关电位P300的诊断价值较体感诱发电位敏感而特异。
6.脑脊液检查 常规，压力及生化均可正常，如同时测定其氨，谷氨酸，色氨酸，谷氨酰胺浓度可增高，在并发脑水肿时压力可升高。
7.脑导磁刺激试验 Nolano等应用脑导磁刺激测定肝硬化病人脑皮质运动功能，发现中央运动神经传导时间延长，睡眠时运动唤醒阈值增高，中枢无记录期明显缩短，外周正常，表明皮质脊髓通路已有损伤，可被认为肝硬化肝性脑病的前期表现。
