1.尿液检查: 大肠埃希杆菌是尿中培养出的最常见的微生物。
2.血液检查: 可见严重贫血。
3.组织病理学检查: 软化斑块多数局限在黏膜，外观表现为柔软，黄色，轻微隆起，并常常融合成3～4cm的斑块，显微镜下斑块由巨噬细胞紧密集结而成，偶尔还有淋巴细胞，巨噬细胞含有丰富的，泡沫状的，PAS阳性的胞质，此外，在巨噬细胞内和组织间质中的MG小体(即无机物的凝结层状物)，MG小体直径4～10mm，PAS染色强阳性，含有钙盐，在电子显微镜下，显示典型的晶状结构，其中心为高密度的核，中间有一个光圈，周围是薄片状的圈，巨噬细胞内有细菌和吞噬溶酶体。
4.CT及磁共振(MRI)检查: CT及磁共振(MRI)检查结果提示非增强CT检查时，软化斑呈极强的高密度(105HU)影;T1-MRI，T2-MRI呈低密度信号，静脉给予钆后有轻度的均一增强效应，以上特征与直肠常见的肿瘤及炎症性病变有别，后两种情况下MRI呈典型的等强度成像，而注射钆后则强度不一，这一观察结果是否适用于肾脏检查有待研究。
5.核素检查: Cox等对双肾软化斑患者进行了核素闪烁检查，结果发现Tc-99m葡庚糖酸盐成像局灶性皮质缺损的对应部位Ga-67活性显著增高，而In-111白细胞肾脏扫描则无显著异常。
