血液检查外周血可有血象白细胞增高，也可正常;重症休克，脱水者可有水，电解质紊乱，代谢性酸中毒等，大便潜血试验阳性。
半数以上病例，腹部平片有可疑表现，如腹部包块影，气体及粪块分布异常，结肠充气减少，出现肠梗阻时的液气平面，但以上均为非特异性表现，诊断不能确定时，可作钡或气灌肠检查，在X线透视下，可见钡柱或气体在结肠的套入部受阻，出现杯状影。
晚期病例如小儿已有严重中毒脱水，高热或休克，腹胀并有腹膜刺激症状时，只宜作低压定量钡或气灌肠检查，注意结肠是否空瘪，特别是乙状结肠，如小肠有多数张力性气液面而结肠空瘪时，即可按绞窄性肠梗阻诊断而进行开腹探查。
辅助检查有：
1.腹部B超检查：在套叠部位横断扫捕可见同心圆或靶环状肿块图像，纵断扫描可见“套简征”。
2.B超监视下水压灌肠：经肛门插入Foley管并将气囊充气20～40ml。将“T'形管一端接Foley管，侧管接血压计监测注水压力，另一端为注水口，注入37℃～40℃等渗盐水匀速推入肠内，可见靶环状块影退至回肓部，“半岛征”由大到小，最后消失，诊断治疗同时完成。
3.空气灌肠： 由肛门注入气体，在x线透视下可见杯口阴影，能清楚看见套叠头的块影，并可同时进行复位治疗。
4.钡剂灌肠： 可见套叠部位充盈缺损和钡剂前端的杯口影，以及钡剂进入鞘部与套入部之间呈现的线条状或弹簧状阴影。只用于慢性肠套叠疑难病例。
