严重的枸橼酸杆菌肺炎可因菌血症或败血症而引起下列并发症：感染性休克，呼吸衰竭，急性心肌炎，心内膜炎，中毒性肝炎，急性肾衰，肺脓肿，脓胸，全身多发性脓肿，DIC等，这时可有相应受损脏器的症状和体征，同时病情恶化，病死率明显增加，预后差。
