行阴茎再植术后可能发生一些并发症，其发生率由高到低依次为：皮肤坏死，尿道狭窄，阴茎远端感觉不良，尿漏，尿道坏死，阳萎，行血管吻合的病例其并发症发生率明显低于仅吻合海绵体和尿道的病例，因而，目前主张行吻合血管的阴茎吻合术。
