新生儿由于免疫系统尚不成熟，很少接触外来抗原，生成的免疫记忆细胞数量少，HIV感染后免疫系统损害较成人严重，潜伏期短，出现症状早，病情进展快，发生淋巴细胞样间质性肺炎和继发细菌感染较多，从母婴传播所致感染的患儿，可早在出生后几个月就出现临床征象，潜伏期数月至数年不等。
1.一般临床表现：有持续发热，消瘦，低出生体重，出生后体重不增，黄疸不退，肝脾肿大，多部位浅表淋巴结肿大等。
2.细菌感染：严重的反复的细菌感染，如败血症，肺炎，腹泻，尿路感染，皮肤感染，中枢神经系统感染等成为婴儿死亡的重要原因之一。
3.机会感染：持续性或反复性鹅口疮。
4.肿瘤：在成人患者中见到的Kaposi肉瘤，在儿童患者中少见。
HIV感染急性期常无症状或症状轻微，易被忽视，因此必须依赖血清学检查，可以用ELISA法测血清抗HIV抗体，如阳性再作Western blot测HIV抗原以确诊，若上述检查均阳性即可诊断HIV感染。
