症状如慢性扁桃体炎。若结石周围有化脓感染，可有咽痛不适与反射性耳痛；重者感吞咽困难，言语含糊不清，口涎增多，张口受限等。有感染时，常自觉口臭。有时结石可自扁桃体上陷窝或舌腭弓处破出。
扁桃体结石可引起慢性口臭和不适。 扁桃体结石的人经常抱怨的实际疼痛和不适从这些小硬化声波提出在他们的喉咙。 除了带来的痛苦，扁桃体结石常常是口臭的病因。 了解扁桃体结石是可以帮助我们理解他们为什么如此糟糕气味和不安。 扁桃体结石是微小的，但阻塞扁桃体的腺管或隐窝，造成引流不畅，细菌繁殖或食物残渣堆积，产生难闻的臭鸡蛋味口臭，严重影响患者生活质量及社会交往。
扁桃体上出现小白斑，不过有时这些小白斑是看不到的;吞咽困难或伴有疼痛。
