本病系由传染性软疣病毒(CMV)所致，属痘类病毒，呈砖形，其直径为350 nm，在光镜下有时亦可见到，据电镜研究，病毒本身的形成与胞质有密切关系，胞质基质先浓缩，并出现嗜酸性颗粒，这些颗粒逐渐团聚，形成与周围有明显界限的“大颗粒”——颗粒组合型病毒(初期型病毒);继而发展成细颗粒膜型病毒(中期型病毒);最后变成砖形，椭圆或圆形，往往在其中心有哑铃状结构之成熟型病毒，整个胞质基质最后变成病毒包涵体(又称软疣小体)，此小体最初为一个卵圆形嗜伊红结构，对Brachet反应呈阳性，示RNA较多，不久Feulgen染色示DNA开始出现阳性反应，随着体积迅速扩大，Feulgen反应也逐渐加强，而Brachet反应则逐渐减弱，这表明在早期RNA的量较多，而在晚期则DNA较多，中医认为系气血失和，腠理不密，复感外邪，凝集肌肤所致，传染性软疣是良性病毒性皮肤疾病，皮疹直径为2～4mm的有蜡样光泽的珠状丘疹，顶端凹陷，能挤出乳酪状软疣小体。
