急性上呼吸道感染如不及时治疗，可引起很多并发症，在婴幼儿时期常并发急性心肌炎，支气管炎，肺炎等，较长儿童可并发肾炎，风湿热，鼻窦炎等，并发症分三大类：
1.感染蔓延至附近器官：感染自鼻咽部蔓延至附近器官，较为常见的有急性结膜炎，鼻窦炎，口腔炎，喉炎，中耳炎和颈淋巴结炎，其他如咽后壁脓肿，扁桃体周围脓肿，上颌骨骨髓炎，支气管炎和肺炎等。
2.感染播散到全身：病原通过血液循环播散到全身，细菌感染并发败血症时，可导致化脓性病灶，如皮下脓肿，脓胸，心包炎，腹膜炎，关节炎，骨髓炎，脑膜炎，脑脓肿和泌尿系感染等。
3.变态反应性疾病：由于感染和变态反应对机体的影响，可发生风湿热，肾炎，肝炎，心肌炎，紫癜，类风湿病及其他结缔组织病等。
