如上所述，骶管囊肿属脊膜囊肿，而非肿瘤，无恶变可能。囊肿内脑脊液压力增高，压迫周围骶神经、骨质，严重者可引起骨质破坏。如果囊肿持续性压迫周围神经纤维，严重患者会出现感觉、运动功能障碍、甚至大小便功能异常。罕见囊肿破裂引起化学性炎症者。
