—旦受染可有数周到6个月的潜伏期,大多数受染的婴儿表现为亚临床过程。
起病缓慢，新生儿出生时多无症状。常在1～6个月间有慢性抗原血症及转氨酶的持续性，轻度增高，有时仅在6～l2个月时检出HBsAg的抗体，新生儿乙型肝炎主要表现为黄疸。可表现为生后黄疸消退延迟，或退而复现，或逐渐加深，部分病例出现临床症状，如黄疸(早期呈阻塞性黄疸的表现)，发热，肝大，食欲欠佳,而后恢复或呈慢性肝炎的经过，也有表现为持续性阻塞性黄疸，巩膜与皮肤黄染，尿色加深如茶色，大便颜色减退或呈陶土色，肝，脾肿大，以肝脏肿大为主，体重不增，尿色较深，多数病人在出生时可完全没有其他临床症状，一般不影响胎儿发育，亦不致畸，甚至没有肝功能及血清学的改变。
少数呈暴发型经过，黄疸出现后迅速加重,短期内发展到肝性脑病，出血等肝功能衰竭症状，死亡快，预后极差，如能存活还可望肝组织恢复正常。
