根据临床表现及检查进行诊断。
(1)排除动脉损伤及周围神经损伤：骨筋膜室综合征和动脉损伤两者的结果都是缺血，所导致的临床表现也有许多相似之处，故有时在判断上会出现混淆误诊，要分析总结各自的临床特点必要时借助仪器检查来做出诊断。动脉损伤有几种情况：破裂、血栓、痉挛以及受到周围组织的压迫阻断(不完全性)使流量减小等，要注意鉴别。骨筋膜室综合征可使动脉搏动减弱或触及不明显，此时不要误以为动脉损伤，两者可相互影响。若合并有周围神经损伤则疼痛表现不明显，此时须重点考虑其他指征。
(2)前臂或小腿的肌肉神经组织发生的缺血要与手足部位出现的缺血表现加以区别或联系：一般情况下骨筋膜室综合征不会完全阻断大动脉的供血，至多会使其减弱，故手足部位不会出现完全性缺血表现或仅有一定程度的供血减弱，不能完全以手足部位的缺血情况来判断前臂或小腿的缺血情况;前臂或小腿的肌肉神经组织发生缺血后则会表现为手足的活动感觉障碍，因此从手足的活动感觉变化可推断出前臂或小腿的缺血情况。
(3)骨筋膜室综合征与挤压综合征是2个概念，要分清楚。
