1.肛管超声(AUS)检查：对复杂的肛周脓性疾病，临床无法明确的脓肿，可用肛管超声检查，有助于确定脓肿和瘘与括约肌的解剖关系，偶尔还能识别内口。
2.直肠指诊：脓肿局部压痛，波动感。
3.穿刺抽吸。
4.排粪造影：可以显示脓肿，瘘管的部位，数量，深度，大小，形态和走向。
5.病理学检查：取脓腔壁进行病理学检查可明确病变性质，如疑有特异性感染或恶性肿瘤，有助于检查。
