组织病理：组织象有特点，为真皮内和皮下组织内界限不清的肿块，瘤细胞较大，呈多角形，形成巢和索，细胞具有丰富细颗粒状，淡嗜酚性胞浆，胞核小而圆，位于细胞中央，核分裂象罕见或无，其上表皮常呈明显上皮瘤性增生，胞浆内颗粒PAS染色阳性，耐淀粉酶，电镜下胞浆内颗粒被膜为溶酶体和自噬体。
免疫组化：细胞对S-100蛋白，CD57(leu-7)，周围神经髓磷脂蛋白，神经元特异性烯醇化酶和波状纤维蛋白呈阳性反应。
通过光学纤维镜、CT、MRI或者内镜检查等辅助手段，可以了解肿瘤发生的部位、侵犯深度以及是否多发生长、有无远处转移等。内镜一方面可作为初次诊断的工具：另一方面也可作为小的肿瘤的治疗措施以及手术后的随访检查方法。由于临床诊断GCT几乎是不可能的，因此组织病理学检查是主要诊断手段，活检样本应在黏膜下或皮下取材。在分类、预测生物学行为和恶性潜在性上，GCT诊断更多需要依靠HE染色而非免疫反应性。由于良恶性GCT组织形态学相似.并且缺乏可靠的预言临床行为的标准，所以很难加以区分。尽管在临床行为和组织形态学上是良性的，但仍有恶性病例。
