(1)中毒性结肠扩张在急性活动期发生，发生率约2%，是由于炎症波及结肠肌层及肌间神经丛，以至肠壁张力低下，呈阶段性麻痹，肠内容物和气体大量积聚，从而引起急性结肠扩张，肠壁变薄，病变多见于乙状结肠或横结肠，诱因有低血钾，钡剂灌肠，使用抗胆碱能药物或鸦片类药物等，临床表现为病情迅速恶化，中毒症状明显，伴腹胀，压痛，反跳痛，肠鸣音减弱或消失，白细胞增多，X线腹平片可见肠腔加宽，结肠袋消失等，易并发肠穿孔，病死率高。
(2)肠穿孔发生率为1.8%左右，多在中毒性结肠扩张基础上发生，引起弥漫性腹膜炎，出现膈下游离气体。
(3)大出血：是指出血量大而要输血治疗者，其发生率为1.1%～4.0%，除因溃疡累及血管发生出血外，低凝血酶原血症亦是重要原因。
(4)息肉本病的息肉并发率为9.7%～39%，常称这种息肉为假性息肉，有人其此分为黏膜下垂型，炎型息肉型，腺瘤样息肉型，息肉好发部位在直肠，也有人认为降结肠及乙状结肠最多，向上依次减少，其结局可随炎症的痊愈而消失，随溃疡的形成而破坏，长期存留或癌变，癌变主要是来自腺癌息肉型。
(5)癌变：发生率报道不一，有研究认为比无结肠炎者高多倍，多见于结肠炎病变累及全结肠，幼年起病和病史超过10年者。
(6)小肠炎：并发小肠炎的病变主要在回肠远端，表现为脐周或右下腹痛，水样便及脂肪便，使患者全身衰竭进度加速。
(7)与自身免疫反应有关的并发症常见者有：
①关节炎：溃疡性结肠炎并发关节炎率为11.5%左右，其特点是多在肠炎病变严重阶段并发，以大关节受累较多见，且常为单个关节病变，关节肿胀，滑膜积液，而骨关节无损害，无风湿病血清学方面的改变，且常与眼部及皮肤特异性并发症同时存在.
②皮肤黏膜病变：结节性红斑为多见，发生率为4.7%～6.2%，其他如多发性脓肿，局限性脓肿，脓疱性坏疽，多形红斑等，口腔黏膜顽固性溃疡亦不少见，有时为鹅口疮，治疗效果不佳。
③眼部病变：有虹膜炎，虹膜睫状体，葡萄膜炎，角膜溃疡等，以前者最多，发病率约5%～10%。
(8)其他并发症：结肠腔狭窄，肛门脓肿，瘘管，贫血，肝损害及肾损害，此外，尚有心肌炎，栓塞性血管炎，胰腺萎缩及内分泌障碍等。
