1.尾蚴性皮炎 尾蚴穿透皮肤往往不被发现，但当大量尾蚴一次性进入人体时，可发生皮肤过敏反应，出现皮肤瘙痒，红斑或荨麻疹等，可持续数天。
2.侵袭期或毒血症期 是指童虫发育为成虫的过程，约2周左右，有季节性差异，如有大量童虫同时到达肺部，可引起痉挛性咳嗽，哮喘，胸痛等症状，但常因症状轻微，短暂而不被注意，更常见的是长期高热，达38～40℃，伴畏寒，出汗，头痛，背痛等，历时数天到3～4个月不等，高热持续较久时，出现精神萎靡，反应迟钝，食欲减退，消瘦及贫血等，说明病情危重，体检：肝，脾中度肿大，可有压痛。
3.症状期 此期出现的泌尿生殖系统症状，是由于成虫在膀胱，输尿管壁及生殖系统大量排卵所致，最初虫卵被大量嗜酸粒细胞，巨噬细胞及组织细胞浸润形成的肉芽肿所包围，肉芽组织又渐被纤维细胞侵入而形成瘢痕，继之虫卵死亡并钙化，引起泌尿生殖器官严重病变，如尿路狭窄及膀胱挛缩等。
(1)膀胱病变：早期症状为镜下血尿，渐发展为尿频，尿痛，尿急，耻骨上及下腰痛，血尿轻重不一，典型者为终末血尿，也可发生全程血尿，膀胱病变可分为3个阶段：
第1阶段：应激性膀胱，膀胱肌肉肥大，易受激惹收缩，可出现暂时性压迫壁段输尿管，输尿管口痉挛性收缩，使输尿管及肾盂内压增高，引起非结石性肾绞痛。
第2阶段：膀胱无力，膀胱肌肉纤维化影响膀胱收缩，如病变继续发展，膀胱壁变薄而扩张，形成三角区后陷窝，如膀胱颈部纤维化而变狭窄，更加重了排尿困难，膀胱壁有假性憩室形成，当逼尿肌代偿失调，开始产生剩余尿，剩余尿过多时，发生假性尿失禁，三角区后陷窝结石等。
第3阶段：挛缩性膀胱，由于膀胱壁纤维化及瘢痕形成而收缩，膀胱容量逐渐变小，此时尿频，尿痛加重，膀胱颈部挛缩严重时，可有逆行射精，膀胱，膀胱颈，输尿管均可有钙化。
(2)输尿管病变：膀胱壁段输尿管受侵犯最为多见，也可侵入下段输尿管，输尿管发生纤维化，狭窄，狭窄以上的输尿管扩张，迂曲，反流和钙化，膀胱及输尿管周围可产生纤维脂肪瘤病，压迫输尿管，加重狭窄，狭窄段以上输尿管及肾积水，埃及血吸虫病中96%有膀胱输尿管反流，更加重了输尿管及肾积水，肾脏形成瘢痕，萎缩，钙化及结石形成，约84%并发细菌感染，导致肾盂肾炎，严重者形成脓肾。
(3)尿道病变：后尿道可出现血吸虫结节及溃疡;前尿道可因继发感染而致狭窄，尿道周围炎，尿道周围脓肿及尿瘘。
(4)生殖器官病变：精囊壁肌层可有血吸虫卵沉积，可使精囊增大，结节形成及变硬，病变扩展到囊壁黏膜，发生溃疡时引起血精，后期继发感染，纤维化，则精囊变小，萎缩，钙化，可导致不育。
血吸虫卵也可沉积在前列腺，多位于前列腺部尿道黏膜，前列腺静脉丛也可有血吸虫结节，这些结节常被误诊为结石，结核或恶性变，症状多为下腰痛，会阴部疼痛及尿道痛，晚期前列腺纤维化，可出现性欲减退，早泄及勃起功能障碍，易误诊为慢性前列腺炎，常需前列腺穿刺活检确诊。
偶有附睾，睾丸发生血吸虫性肉芽肿，埃及血吸虫病多见于成年女性外阴及阴道下部，也可见于子宫颈，子宫，卵巢及输卵管，病变多为溃疡及肉芽肿，症状为脓性白带，性交后出血。
