碘缺乏病的临床表现取决于缺碘的程度，缺碘时机体所处发育时期，以及机体对缺碘的反应性或对缺碘的代偿适应能力。如碘缺乏发生在胚胎脑组织发育的关键时期(从妊娠开始至出生后2岁)，则主要影响智力发育，并有身体发育及性发育障碍，即为克汀病；如碘缺乏是在儿童期，即可发生甲状腺肿。
1.地方性甲状腺功能减退症
可分为3型：神经型、黏液性水肿型、混合型，大多数患儿表现为混合型。
(1)神经型：智力呈中度及重度减退，甲状腺轻度肿大，身高可正常，表情淡漠，聋哑，多有精神缺陷，眼多斜视，痉挛或瘫痪，膝关节屈曲，膝反射亢进，可出现病理反射，甲状腺功能正常或轻度低下。
(2)黏液性水肿型：轻度智力低下，有的能说话，侏儒状态明显，生长发育和性发育落后，有甲状腺肿大和严重的甲状腺功能低下表现，有典型的面容，便秘及黏液性水肿较突出，某些病人呈家族性发病。
(3)混合型：其临床表现两者均有，两种类型地方性甲状腺功能减退症的临床表现的比较。
2.甲状腺肿
根据甲状腺肿是否伴有结节，分为以下3型：
(1)弥漫型：甲状腺均匀增大，摸不到结节。
(2)结节型：在甲状腺上摸到一个或几个结节。
(3)混合型：在弥漫肿大的甲状腺上，摸到一个或几个结节。
甲状腺如肿大明显，可压迫气管引起咳嗽和呼吸困难，压迫食管引起咽下困难，压迫喉返神经引起声音嘶哑，胸骨后甲状腺肿可使头部、颈部、上肢静脉回流受阻，表现为面部青紫、水肿。
3.亚临床患者
(1)类甲状腺功能减退症：
除了明显的甲状腺功能减退症和地方性甲状腺肿外，还存在着许多亚临床患者，De Quarrain与Wegelin首先用类甲状腺功能减退症来描述亚临床患者，并做如下规定：如有可疑甲状腺功能低下，可疑智力低下或两者均有，只要有其中一项，则考虑为类甲状腺功能减退症。
(2)亚临床体格发育落后综合征：
主要是身高和体重低于正常儿童，某些生理检查指标如握力、肺活量和血压等也偏低，少数人还有轻度骨骺发育落后，性发育落后一般不明显。
