肾结核的主要原发病灶为肺结核，少数来自于骨，关节，肠，淋巴结的结核病灶，偶有从生殖道蔓延到肾脏。
1.常见的病原体：本病最常见的病原体是人型结核分枝杆菌。
2.少见的病原体：其他少见病原体包括牛型结核杆菌及未定型分枝杆菌等。
肾结核的主要原发病灶为肺结核，少数来自于骨，关节，肠，淋巴结的结核病灶，偶有从生殖道蔓延到肾脏，肾脏结核的基本病理改变为结核结节或结核性肉芽肿形成，结核结节的中心为干酪样坏死组织，周围为类上皮细胞及laugharis巨细胞，外围为淋巴细胞及纤维组织，结核杆菌经血路侵入双肾，先在双侧肾脏的肾小球毛细血管丛中形成微结核病灶(病理性肾结核)，在机体抵抗力正常的情况下，微结核病灶可痊愈或长期处于静止状态，不出现临床症状，但未痊愈的微结核病灶可引起结核菌尿，初起病变是一个肾小球结核结节，以后可发生坏死性损害，并且蔓延到小管，大多数病例从隐匿到再活动10～40年，一旦形成干酪样坏死损害，极少能自愈，发生坏死性乳头炎到肾实质空洞形成，钙沉积;感染继续播散，肾盂炎症到纤维化，影响集合系统，形成狭窄和肾盂积水，如果实质纤维化进展，肾内血管狭窄，致纤维化，最终肾结构破坏，若“种植”到尿，可发生尿道炎，膀胱炎(伴有溃疡形成，纤维化及壁增厚)。
