1.血象检查
外周血检查贫血常见，多为小细胞低色素性贫血，如果有叶酸和维生素B12吸收障碍，可为大细胞性贫血，活动期外周血白细胞升高。
2.血液检查
由于吸收不良可致血浆白蛋白降低，低钙(低镁及低锌)血症，维生素D缺乏，活动期血沉加快，近期有报道在本病的活动期结肠黏膜含IgG的细胞增多，而静止期含IgM的细胞增多，可作为与溃疡性结肠炎的鉴别。
3.粪便检查
大便隐血试验常呈阳性。
4.X线检查
应包括钡餐及钡灌肠，X线表现为肠道炎性病变，早期只见规则的肥厚黏膜，呈结节状改变，肠管僵直，韧性差，可见黏膜皱襞粗乱，纵行性溃疡或裂沟，病变呈节段性分布，由于病变段激惹及痉挛，钡剂很快通过而不留该处，称为跳跃征，病变间黏膜正常;钡剂迅速通过而遗留一细线条状影，称为线样征，病变段黏膜糜烂，结节不平，可见深，大的纵行龛影，边界不规则，周边小结节隆起，部分患者可有所谓“卵石征”，多个半圆形，铺路石样充盈缺损，也可见瘘道内有造影剂充填，瘘道不规则，造影检查尤应注意回肠末段及回盲部征象，长期慢性患儿可见病变肠管黏膜皱襞增宽，平坦或裂隙条状存钡带，正常纹理消失，有时黏膜突起呈“鹅卵石征”，假息肉，多发性狭窄，瘘管形成，病变肠段蠕动减弱或消失，肠襻僵直呈铅管状，若有内瘘形成可出现钡剂分流，并可出现溃疡龛影。
5.结肠镜与活组织检查
纤维结肠镜检查对诊断局限性回肠炎十分重要，内镜下不但可见黏膜病变直观表现，而且反复活检有助于提高一些重要证据如非干酪样肉芽肿，裂隙性溃疡等的检出率，可观察结肠病变部位的黏膜炎症，溃疡，并可取活检，病理证实为非干酪性肉芽肿即可确诊，直肠，乙状结肠病变的早期常为多发性边界清楚隆起的小红斑，可见病变呈节段性分布，见纵行或匐行性溃疡，溃疡周围黏膜正常或增生呈鹅卵石样，肠腔狭窄，炎性息肉，病变肠段之间黏膜外观正常，红斑黏膜活组织检查可见固有膜的浅层有水肿，局灶出血和隐窝破裂，其中有的是可逆的，有的形成纵形溃疡，活检发现黏膜固有层有非干酪坏死性肉芽肿或大量淋巴细胞聚集，为早期诊断提供依据，内镜检查还可以了解疾病的活动程度，与X线造影相似的是，一次内镜检查如未能发现重要表现，不能由此否定诊断，需根据病情发展，反复选择检查，这一点在临床上常常要考虑到。
